第165章 这也太能装了吧？（1/2）

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随着思路彻底打开，林晓越说越投入。

脑海中的思绪飞速运转，无数零散的知识点相互串联、碰撞，生出全新的火花。

“不过我目前还不确定这个构想在数学层面是否完全成立。”林晓语气保持着坦诚谦逊，“我只是在课堂上看到您用到的矩阵分解框架，恰好联想到自己之前接触的育种数据，发现两者存在高度相似的结构特征。”

他抬眼看向邦妮·伯杰，抛出了自己最终的核心疑问。

“所以我想请教您，DCA这套成熟的统计框架，是否可以跳出蛋白质结构预测的固有局限，被重新解读为一种通用的基因组去混杂算法？”

面对这个大胆又新颖的问题，邦妮·伯杰没有轻易给出肯定或否定的答案。

深耕计算生物学多年，她早已养成极致严谨的治学思维。

生物从来不是纯理论推演的学科，任何构想、任何猜想，最终都要落地于真实数据和实验结果，唯有实验数据最具说服力。

她微微沉吟，缓缓开口，语气格外认真：“问题在于......这并不是一个纯数学问题。”

“生物学其实是一门实验学科，只有真实的实验数据才能说话。”

“这也是我没办法立刻回答你的原因。”

“在DCA的生物学上下文中，这个低秩结构所对应的到底是什么？”

“在你的育种场景中，低秩部分可能是群体分层。”

“但在蛋白质结构预测中，如果我们把同样的方法应用到MSA上，那个低秩部分可能对应的是什么呢？”

“可能对应的是每个蛋白家族共享的全局氨基酸偏好，也可能对应的是序列采样偏差。但如果对应的是这些，那么这个分解就和物理接触图无关了。”

“所以我需要知道的是：你是打算把这个方法用在育种数据上，还是打算用它来解决结构预测本身的问题？”

“因为这两个场景，对低秩部分的生物学解释是完全不同的。”

这个问题直接问到了点子上。

林晓愣了一下，他好像还真没考虑到这一点。

就在林晓凝神思索、短暂沉默之际。

办公室门外传来一道清脆的女声，打破了室内的静谧。

“导师，您不是上完课就回实验室的吗？”

话音落下，一名脸颊带着些许浅褐色雀斑的女生推门而入。

“怎么现在还.....”

女生话没说完，结果发现办公室里居然还有一个陌生的男生。

顿时戛然而止，神色满是诧异。

邦妮?伯杰看了她一眼道：“是琼斯啊，你先地方坐。”

琼斯乖乖点头落座，但心里早已掀起波澜，满脸问号。

本科生？？？

能和她的研究生导师交流什么东西？

这是她从未见过的情况。

压下心底的疑惑，琼斯没有出声打断，默默坐在一旁旁听，眼神却始终带着好奇。

邦妮·伯杰收回目光，重新落回林晓身上，随口问道：“你本科读的是生物还是数学？”

“算是主修生物，辅修计算机。”林晓如实回答。

似乎觉得这个答案听起来有点奇怪。

他又接着补充了一句：“我之前偶然拜读过您实验室关于压缩基因组学的论文，也是那篇文献，让我注意到了矩阵分解的应用思路，才有了这次的想法。”

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