第245章 好像也没那么难嘛(2/2)
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左边是一群玉米,高矮胖瘦各不相同。
右边是一张染色体示意图,上面标着密密麻麻的SNP位点。
他指着左边那堆玉米说:“这是表型。”
又指着右边那张图说:“这是基因型。”
“过去几十年,育种家一直在做一件事,把左边和右边连起来。”
讲台下没有人说话,但那些视线都落在同一个方向。
“传统的方法是通过连锁分析、GWAS、BLUP来建立这种连接。”
“这些工具有效,但都依赖一个前提,那就是你需要先知道哪些表型值得关注。”
“如果不知道呢?如果你还没有选出那个值得关注的表型呢?”
林晓在这里停了一下,然后才继续说道。
“那就需要另一套逻辑,从基因型本身出发,先问一个问题。”
“这些位点之间有没有关联?不是表型上的关联,是变异模式上的关联。”
说到这里,林晓转身用笔在白板上写下了四个大字。
统计耦合。
“统计耦合这东西,要说清楚它的来路,得从三个人讲起。”
“第一个是个物理学家,二十年前在PNAS上发了一篇论文,说蛋白质里那些一起变的氨基酸,在三维结构里大概率是挨着的。
“所以他管这个叫直接耦合分析。”
“当时大家一看,都惊为天人。
“觉得这个发现简直太酷啦,于是争相引用,发了一堆论文。”
这下。
不论是台下的新生小登,还是来蹭课学习的本科中登,或者是专门来凑热闹的研究生老登。
大部分人都笑出了声。
“然后过了十几年,有个搞计算的人拿着这套方法,往基因组数据上试了一下,发现也跑得通。”
“他换了个名字叫统计耦合,觉得这样听起来更通用。”
“但这时候问题来了。”
“大家都在用这个方法,却没有人能说清楚它在基因组上到底算什么意思。”
这其实就是DAC的发展历程,正常来说是非常无聊的内容。
他们显然没想到林晓的讲课风格居然这么接地气。
没有直接一开始就甩出什么枯燥的概念定义。
也没有机械化的直接照着PPT念。
就是这种讲故事的方式。
众人都被他勾起了好奇心。
不少前排的新生都跟着点头,有的甚至小声讨论起来。
“这个什么统计耦合其实学起来,好像也没那么难嘛!”
“是啊,有人劝我千万别来,说去了也是听天书。”
“你这肯定被忽悠了啊,不然怎么能来这么多人。”
而角落里的一些正在摸鱼的研究生老登也有些意外。
“这家伙好像有两把刷子啊!”
“不止两把,我都感觉比我导讲的好了。”
“啊啊啊啊啊!这是不是扰乱市场了?”
“是啊!我们研究生真不会给人上课啊!!!”
而台上的林晓显然没管这些动静,继续介绍。
“直到某天,一个本科生在蹭了MIT的一节课后。”
“他盯着DCA的公式看了半天,忽然意识到一件事。”
“等等~”
“这个东西其实不需要和物理接触绑在一起。”
“它本质上就是一个这俩位置不能同时乱变的统计描述。”
“于是他顺着这个思路往下做了下去。”
“于是,这个发现的成果最后出现在PNAS的封面上。”
“所以这个故事告诉我们。”
“因为跑在一条对手尚未发现的时间轴上,所以现在DCA成了育种领域的新工具。”
“同一个算法工具,落在不同人手里,有时候能改变它的定义方式。”