第366章 我就想安安静静钓个鱼(1/2)
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“第一部分是蛋白质尺度上的构象信号传递建模。”
“这一块的方法基础和我之前做的糖质结构预测有直接关联,我可以牵头。”
“但我需要一个人帮我处理构象动力学模拟的数据接口,把模拟输出的构象系综转换成信号传递模型可以读取的格式。”
“这个工作偏工程,不需要太多理论推导,但需要细心。”
就在这时,威廉姆斯举起手:“我来。”
“我之前跑过分子动力学模拟,对构象系综的数据结构比较熟。”
“接口的事我来对接。”
林晓点头:“好。第二部分是信号通路尺度上的级联响应分析。”
“这一块需要读一批细胞信号转导的文献,建一个通路之间的耦合模型。”
“这一块的我们实验室比较薄弱,需要有人从头搭起来。”
“卢卡斯,你之前做过基因调控网络的分析,跟这个方向有重叠,你有没有兴趣?”
卢卡斯想了想:“可以。但我需要琼斯帮我做文献筛选和整理。细胞信号转导的文献量很大,我一个人筛不过来。”
琼斯说:“没问题。我先把近五年的综述筛一遍,把核心通路和已有的耦合模型列出来,然后你再看具体的研究论文。”
林晓说:“好。第三部分是细胞群体尺度上的协同响应建模。”
“这一部分我暂时没有想清楚该怎么做,需要等到前两部分跑通之后再重新评估。”
“在那之前,我们可以先不考虑它。如果后面有需要,我再跟邦妮教授讨论是否要调整任务分配。”
威廉姆斯这时问了一句:“那时间节点怎么定?”
林晓把任务文档翻到第二页:“第一部分,蛋白质尺度的建模,我给三周。”
“前一周做数据接口,后两周跑模型和初步验证。第二部分,通路尺度,我给四周。”
“前两周做文献调研和模型框架设计,后两周做耦合分析和验证。”
“第三部分暂定六周之后启动,具体时间等前两部分结束再定。”
卢卡斯看了一眼自己的日程表:“嘶!四周做通路尺度,时间有点紧啊!”
“我知道。”林晓说,“所以文献调研的部分琼斯会帮你分担。你只需要看核心论文,综述和背景整理交给琼斯。如果有必要,我也可以帮你筛一部分。”
卢卡斯点了点头,没有再说什么。
威廉姆斯把笔拿起来,在自己的笔记本上写了几行字,然后抬头问了一句:“那我们每周碰一次还是两次?”
“先每周一次,周五下午。如果进度有问题,随时加会。”林晓说,“我建了一个共享文档,每个人的任务和进度都写在上面,你们随时更新。我每天晚上会看一遍。”
威廉姆斯把笔放下,靠回椅背上:“行,我没问题。”
琼斯已经在笔记本上把任务分工抄了下来,然后在旁边标注了文献筛选的起止时间和交付格式。
卢卡斯转回屏幕前,打开了一个新的文档,开始列文献关键词。
林晓把任务文档保存好,共享给三个人,然后转回自己的电脑,开始处理第一部分的构象信号传递建模。
他在心里算了一下时间。
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